Zuzenbidean lizentziaduna (1987) eta doktorea (1993) izan zen UPV/EHUn. Juanjo Álvarez Rubio zumaiarra Innobasque Berrikuntzaren Euskal Agentzian sartzen da bazkide gisa.
Alvarez Rubiok Humanitate, Kultura, Arte eta Gizarte Zientzien Eusko-Ikaskuntza-Laboral Kutxa Saria jaso du. Globernance (Gobernantza Demokratikorako Institutua) erakundearen sortzailea eta idazkaria da. Gainera, Europako Mugimenduaren Euskal Kontseiluko (Eurobask/CVME) idazkari nagusia izan da, eta Europako Batzorderako aditua Justizia Zibilaren, mugen, datu pertsonalen babesaren eta segurtasunaren arloetan.
Bere ikerketa-ildoak Itsas Zuzenbidea, Nazioarteko Merkataritzaren Zuzenbidea eta Giza Eskubideak, Europako Zuzenbidea eta barne-gatazkei lotutako eremuak dira. Zazpi monografiaren egilea da, 68 zientzia-libururen egileetako bat, berrogeita hamar artikulu baino gehiago aldizkari espezializatuetan, eta nazioko eta nazioarteko 150 kongresu baino gehiagotan parte hartu du. Gainera, CNEIk aitortutako 4 seiurteko ditu.
Zalantzarik gabe, atxikimendu handia Innobasqueren bazkide-baseari. Ongi etorri!